中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德研究所研究員郝沛
發(fā)現(xiàn)“敵情”的偵察兵
“此項(xiàng)數(shù)據(jù)結(jié)果讓我預(yù)感到病毒有潛在的高傳染力?!焙屡嬲f。
1月12日下午,郝沛在熬了整整一個(gè)通宵后,終于看到了團(tuán)隊(duì)分析的新發(fā)病毒全基因組數(shù)據(jù)結(jié)果。“通過對(duì)武漢的新型冠狀病毒spike蛋白的結(jié)構(gòu)模擬計(jì)算,預(yù)測(cè)新型冠狀病毒spike蛋白可以與人ACE2蛋白結(jié)合,可能通過該機(jī)制感染人體上呼吸道表皮細(xì)胞。”
17年前的一段經(jīng)歷瞬間劃過郝沛腦海?!澳嵌谓?jīng)歷讓我學(xué)到了不少生物信息數(shù)據(jù)分析知識(shí),也積累了不少經(jīng)驗(yàn)”。2003年4月“非典”疫情暴發(fā)后,郝沛參與了SARS相關(guān)研究工作,負(fù)責(zé)數(shù)據(jù)分析。后來(lái),她作為并列第一作者,先后在《科學(xué)》《國(guó)家科學(xué)院院報(bào)》等國(guó)際學(xué)術(shù)期刊發(fā)表了相關(guān)結(jié)果。
情況緊急,郝沛立即拿著數(shù)據(jù)結(jié)果與冠狀病毒領(lǐng)域的專家們以及合作者開展了討論。大家一致認(rèn)為,數(shù)據(jù)結(jié)果可以為其他科研人員提供學(xué)術(shù)參考,也可以為科研人員了解此次病毒的起源、原生宿主,以及評(píng)估病毒在物種間或人類之間公共傳播的風(fēng)險(xiǎn)提供幫助。在補(bǔ)充了新的數(shù)據(jù)之后,1月21日他們的數(shù)據(jù)結(jié)果以論文形式發(fā)布于《中國(guó)科學(xué):生命科學(xué)》,引起廣泛關(guān)注。
大年初一把娃送走的婦委主任
郝沛是科學(xué)家,也是一位母親。談到女兒,郝沛眼里流露出無(wú)限的愛意。她喜歡女兒畫的《我們仨》,畫里的媽媽眼睫毛特別長(zhǎng),方臉的爸爸戴著紅色的領(lǐng)結(jié)。平日里,女兒喜歡吃媽媽做的蔥油餅,牛軋?zhí)恰?歲的女兒聰明伶俐,熱愛運(yùn)動(dòng)。小姑娘會(huì)打冰球,球齡5年,是近期熱播的少兒燃動(dòng)冰雪成長(zhǎng)節(jié)目《大冰小將》里的小明星,人氣指數(shù)比媽媽高。在網(wǎng)友眼里,她是“比男生還勇敢的小小美少女”。
對(duì)于這個(gè)特別假期的安排,郝沛對(duì)女兒有太多的歉疚?!?6號(hào)完成論文遞交后,按原計(jì)劃陪女兒去東北滑雪,但是說是陪女兒滑雪,其實(shí)是去把女兒丟給了朋友。真的很感謝我的朋友們,不僅管飯、幫女兒看作業(yè)補(bǔ)功課,還堅(jiān)持體育訓(xùn)練?!?/p>
1月25日,大年初一,為了能專心科研工作,郝沛毅然把閨女送到了朋友家照顧。“大過年的,女兒不在身邊……” 丈夫?qū)τ谶@樣的安排流露出了遺憾。對(duì)此,郝沛沉默了。她的心里有更重要的事情放心不下。她也知道,在工作上,丈夫總是給她大力支持。
1月26日,大年初二,郝沛就到單位開始上班了,參加所里科研攻關(guān)組的工作,隨時(shí)準(zhǔn)備為研究團(tuán)隊(duì)做各種協(xié)調(diào)工作。因?yàn)橐咔樾蝿?shì)嚴(yán)峻,郝沛并沒有讓她研究團(tuán)隊(duì)里的科研人員到所里上班,讓他們?cè)诩肄k公。
作為所里的婦委主任,郝沛盡心盡力組織開設(shè)瑜伽培訓(xùn)班、維護(hù)媽咪小屋、籌備婦女之家。今年3月8日婦女節(jié),郝沛也惦記著所里的姐妹們。往年她組織所里的姐妹們一起看話劇,一起學(xué)化妝;今年的情況特殊,郝沛就給所里的姐妹們安排了實(shí)用版的“女神節(jié)”慰問品。
用初心溫暖最冷的寒冬
“作為這個(gè)領(lǐng)域的科研人員要時(shí)刻保持警惕性和好奇心。” 談及科研初心,郝沛如是說。
郝沛所在的中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德所,是2003年“非典”疫情之后,中國(guó)科學(xué)院為對(duì)抗傳染病成立的研究所。這個(gè)初心也是整個(gè)研究所多年來(lái)不畏艱難、砥礪前行的動(dòng)力。這也是中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德所吸引郝沛的重要原因?!拔沂潜就脸砷L(zhǎng)的研究員,我感謝上海巴斯德所給我獨(dú)立成長(zhǎng)的機(jī)會(huì)?!?沒有海外留學(xué)經(jīng)歷的郝沛心存感恩。
新冠肺炎疫情發(fā)生以來(lái),中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德所迅速行動(dòng),組建了科技攻關(guān)團(tuán)隊(duì),所長(zhǎng)、黨委委員唐宏同志擔(dān)任科技攻關(guān)臨時(shí)黨支部書記。
1月27日,大年初三,郝沛和中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德所科研骨干一起在科技攻關(guān)《請(qǐng)戰(zhàn)書》上鄭重簽上了自己的名字,《請(qǐng)戰(zhàn)書》中寫道:“我們?cè)笧閼?zhàn)勝新型冠狀病毒疫情隨時(shí)聽候調(diào)遣,我們?nèi)w隊(duì)員都義無(wú)反顧!”
“我們家,我爸爸和我都是黨員,我是在上海交通大學(xué)讀大二的時(shí)候入的黨。”1月31日,大年初七,擁有25年黨齡的郝沛積極響應(yīng)研究所所黨委的號(hào)召,遞交了自己的“特殊黨費(fèi)”,為抗疫奉獻(xiàn)“老黨員”的一份深情。
病毒基因組自動(dòng)化鑒定云平臺(tái)(VIC)上線
“從年前至今,我們的工作一直沒有停止?!睂?duì)于最新的工作進(jìn)展,郝沛介紹說,“我們和中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所共同開發(fā)了病毒基因組自動(dòng)化鑒定云平臺(tái)(Virus Identification Cloud, VIC),直接對(duì)接人體樣本的RNA二代測(cè)序原始數(shù)據(jù),具有對(duì)數(shù)據(jù)全自動(dòng)質(zhì)量控制、拼接和病毒組成分析等功能,實(shí)現(xiàn)了快速檢測(cè)樣本中可能存在的包括新型冠狀病毒在內(nèi)的各種病毒,并在線分析其相對(duì)載量?!?/p>
郝沛表示,開發(fā)這個(gè)平臺(tái)的目的是希望能夠用擅長(zhǎng)的生物信息學(xué)技術(shù),協(xié)助醫(yī)院機(jī)構(gòu)很快作出專業(yè)判斷。
“目前我們已經(jīng)協(xié)助上海市公共衛(wèi)生臨床研究中心和上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院進(jìn)行臨床樣本數(shù)據(jù)分析。我們還在改進(jìn)流程,希望能基于這個(gè)流程構(gòu)建病原大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),在疫情過后對(duì)更多的病原微生物進(jìn)行分析監(jiān)測(cè)?!?/p>
對(duì)于新型冠狀病毒的溯源研究工作,郝沛說:“我們?cè)谂Ψ治鲅芯恳吧鷦?dòng)物病毒結(jié)合受體的數(shù)據(jù),模擬預(yù)測(cè)其病毒S蛋白接合的能力,從分子生物學(xué)角度篩選新冠病毒的中間宿主野生動(dòng)物?!焙屡嫜a(bǔ)充道,“我們也在搜集整理已經(jīng)公開的相關(guān)野生動(dòng)物的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),進(jìn)行數(shù)據(jù)分析?!?/p>
疫情當(dāng)前,科研不止。當(dāng)初春的陽(yáng)光透過法國(guó)梧桐樹灑在科學(xué)大院的時(shí)候,郝沛和她的隊(duì)友們堅(jiān)信:總有云開日出時(shí)。
因?yàn)?,春天的腳步已經(jīng)到來(lái)。